Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttf2Q5NC05 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttf2Q5NC05 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttf2Q5NC05 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms