Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CoblQ5NBX1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CoblQ5NBX1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CoblQ5NBX1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CoblQ5NBX1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CoblQ5NBX1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CoblQ5NBX1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CoblQ5NBX1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CoblQ5NBX1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CoblQ5NBX1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CoblQ5NBX1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
CoblQ5NBX1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CoblQ5NBX1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CoblQ5NBX1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 416.7 ms