Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Znf354cQ571J5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Znf354cQ571J5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf354cQ571J5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf354cQ571J5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms