Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lrrc47Q505F5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lrrc47Q505F5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc47Q505F5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms