Protein–RNA interactions for Protein: Q501J7

Phactr4, Phosphatase and actin regulator 4, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr4Q501J7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phactr4Q501J7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Phactr4Q501J7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Phactr4Q501J7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Phactr4Q501J7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms