Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc84Q4VA36 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc84Q4VA36 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc84Q4VA36 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms