Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rhox3aQ4TU90 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox3aQ4TU90 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms