Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Khdc1cQ4KL78 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc1cQ4KL78 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms