Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ddx49Q4FZF3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ddx49Q4FZF3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddx49Q4FZF3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx49Q4FZF3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms