Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2al1nQ497L1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1nQ497L1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms