Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Krt35Q497I4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt35Q497I4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt35Q497I4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms