Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3R4

Itga1, Integrin alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga1Q3V3R4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Itga1Q3V3R4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Itga1Q3V3R4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms