Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ckap2Q3V1H1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ckap2Q3V1H1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ckap2Q3V1H1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ckap2Q3V1H1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms