Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp4r3cQ3V0Y1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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