Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bbof1Q3V079 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bbof1Q3V079 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bbof1Q3V079 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms