Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc9Q3V038 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ttc9Q3V038 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms