Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SvipQ3UZP4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SvipQ3UZP4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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