Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
E330034G19RikQ3UWX6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
E330034G19RikQ3UWX6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
E330034G19RikQ3UWX6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms