Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nr1d1Q3UV55 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nr1d1Q3UV55 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nr1d1Q3UV55 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nr1d1Q3UV55 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nr1d1Q3UV55 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nr1d1Q3UV55 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nr1d1Q3UV55 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nr1d1Q3UV55 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nr1d1Q3UV55 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nr1d1Q3UV55 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nr1d1Q3UV55 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nr1d1Q3UV55 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nr1d1Q3UV55 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nr1d1Q3UV55 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nr1d1Q3UV55 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr1d1Q3UV55 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr1d1Q3UV55 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr1d1Q3UV55 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr1d1Q3UV55 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr1d1Q3UV55 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr1d1Q3UV55 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr1d1Q3UV55 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr1d1Q3UV55 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr1d1Q3UV55 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr1d1Q3UV55 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 952 ms