Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Nhlrc4Q3UP44 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlrc4Q3UP44 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlrc4Q3UP44 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms