Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cracr2aQ3UP38 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cracr2aQ3UP38 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cracr2aQ3UP38 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms