Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdgfl2Q3UMU9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hdgfl2Q3UMU9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms