Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM45

Ppp1r7, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r7Q3UM45 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ppp1r7Q3UM45 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ppp1r7Q3UM45 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms