Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULF4

Spg7, Paraplegin, mousemouse

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg7Q3ULF4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Spg7Q3ULF4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Spg7Q3ULF4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Spg7Q3ULF4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 272.8 ms