Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fam83fQ3UKU4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam83fQ3UKU4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fam83fQ3UKU4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms