Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnf224Q3UIW8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf224Q3UIW8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf224Q3UIW8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf224Q3UIW8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf224Q3UIW8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf224Q3UIW8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf224Q3UIW8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf224Q3UIW8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf224Q3UIW8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf224Q3UIW8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnf224Q3UIW8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf224Q3UIW8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rnf224Q3UIW8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf224Q3UIW8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rnf224Q3UIW8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms