Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc34Q3UI66 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc34Q3UI66 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.4 ms