Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccser2Q3UHI0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccser2Q3UHI0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccser2Q3UHI0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccser2Q3UHI0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccser2Q3UHI0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccser2Q3UHI0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccser2Q3UHI0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccser2Q3UHI0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccser2Q3UHI0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccser2Q3UHI0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccser2Q3UHI0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccser2Q3UHI0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccser2Q3UHI0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccser2Q3UHI0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccser2Q3UHI0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccser2Q3UHI0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccser2Q3UHI0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccser2Q3UHI0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccser2Q3UHI0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccser2Q3UHI0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccser2Q3UHI0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccser2Q3UHI0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccser2Q3UHI0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccser2Q3UHI0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccser2Q3UHI0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccser2Q3UHI0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms