Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnrc6cQ3UHC0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnrc6cQ3UHC0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnrc6cQ3UHC0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tnrc6cQ3UHC0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms