Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc177Q3UHB8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc177Q3UHB8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms