Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Zyg11bQ3UFS0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Zyg11bQ3UFS0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zyg11bQ3UFS0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms