Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf166Q3U9F6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf166Q3U9F6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 347.9 ms