Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Rnf149Q3U2C5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf149Q3U2C5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf149Q3U2C5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf149Q3U2C5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf149Q3U2C5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf149Q3U2C5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf149Q3U2C5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf149Q3U2C5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnf149Q3U2C5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Rnf149Q3U2C5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf149Q3U2C5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf149Q3U2C5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf149Q3U2C5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Rnf149Q3U2C5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnf149Q3U2C5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Rnf149Q3U2C5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Rnf149Q3U2C5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Rnf149Q3U2C5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf149Q3U2C5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf149Q3U2C5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Rnf149Q3U2C5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf149Q3U2C5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Rnf149Q3U2C5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf149Q3U2C5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Rnf149Q3U2C5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf149Q3U2C5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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Rnf149Q3U2C5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf149Q3U2C5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnf149Q3U2C5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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