Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1J0

Slc38a5, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a5Q3U1J0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc38a5Q3U1J0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc38a5Q3U1J0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc38a5Q3U1J0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc38a5Q3U1J0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc38a5Q3U1J0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc38a5Q3U1J0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slc38a5Q3U1J0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc38a5Q3U1J0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc38a5Q3U1J0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms