Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc174Q3U155 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc174Q3U155 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc174Q3U155 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms