Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccndbp1Q3TVC7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccndbp1Q3TVC7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccndbp1Q3TVC7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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