Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS87

9130409I23Rik, MCG19844, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9130409I23RikQ3TS87 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
9130409I23RikQ3TS87 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
9130409I23RikQ3TS87 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
9130409I23RikQ3TS87 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
9130409I23RikQ3TS87 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
9130409I23RikQ3TS87 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
9130409I23RikQ3TS87 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms