Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pnpla6Q3TRM4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pnpla6Q3TRM4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms