Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctdnep1Q3TP92 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctdnep1Q3TP92 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctdnep1Q3TP92 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms