Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trappc13Q3TIR1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trappc13Q3TIR1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trappc13Q3TIR1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms