Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc69Q3TCJ8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms