Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cul4aQ3TCH7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms