Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms