Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbp8Q2V6D6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbp8Q2V6D6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gbp8Q2V6D6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp8Q2V6D6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp8Q2V6D6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp8Q2V6D6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp8Q2V6D6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp8Q2V6D6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp8Q2V6D6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp8Q2V6D6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp8Q2V6D6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gbp8Q2V6D6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp8Q2V6D6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp8Q2V6D6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp8Q2V6D6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp8Q2V6D6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp8Q2V6D6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gbp8Q2V6D6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp8Q2V6D6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp8Q2V6D6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp8Q2V6D6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gbp8Q2V6D6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gbp8Q2V6D6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gbp8Q2V6D6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gbp8Q2V6D6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp8Q2V6D6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp8Q2V6D6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp8Q2V6D6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp8Q2V6D6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp8Q2V6D6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp8Q2V6D6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gbp8Q2V6D6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp8Q2V6D6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp8Q2V6D6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp8Q2V6D6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp8Q2V6D6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gbp8Q2V6D6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp8Q2V6D6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gbp8Q2V6D6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms