Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vax1Q2NKI2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vax1Q2NKI2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vax1Q2NKI2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms