Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpne9Q1RLL3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpne9Q1RLL3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne9Q1RLL3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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