Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim71Q1PSW8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trim71Q1PSW8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trim71Q1PSW8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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