Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam171bQ14CH0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam171bQ14CH0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam171bQ14CH0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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