Protein–RNA interactions for Protein: Q0WXH6

Gm7030, MHC class Ib T9, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7030Q0WXH6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm7030Q0WXH6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm7030Q0WXH6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm7030Q0WXH6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm7030Q0WXH6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm7030Q0WXH6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm7030Q0WXH6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm7030Q0WXH6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm7030Q0WXH6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm7030Q0WXH6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm7030Q0WXH6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm7030Q0WXH6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm7030Q0WXH6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm7030Q0WXH6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm7030Q0WXH6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm7030Q0WXH6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm7030Q0WXH6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm7030Q0WXH6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm7030Q0WXH6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm7030Q0WXH6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm7030Q0WXH6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Gm7030Q0WXH6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm7030Q0WXH6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm7030Q0WXH6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm7030Q0WXH6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm7030Q0WXH6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm7030Q0WXH6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm7030Q0WXH6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm7030Q0WXH6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm7030Q0WXH6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm7030Q0WXH6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm7030Q0WXH6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm7030Q0WXH6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm7030Q0WXH6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm7030Q0WXH6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm7030Q0WXH6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm7030Q0WXH6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm7030Q0WXH6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm7030Q0WXH6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm7030Q0WXH6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1244 ms