Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtel1Q0VGM9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtel1Q0VGM9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtel1Q0VGM9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtel1Q0VGM9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtel1Q0VGM9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtel1Q0VGM9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtel1Q0VGM9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtel1Q0VGM9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtel1Q0VGM9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtel1Q0VGM9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtel1Q0VGM9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtel1Q0VGM9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtel1Q0VGM9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtel1Q0VGM9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtel1Q0VGM9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtel1Q0VGM9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rtel1Q0VGM9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rtel1Q0VGM9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtel1Q0VGM9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms